DIagnóstico PROteómico de la Artrosis (DIPROA)

Proyecto FEDER INNTERCONECTA

Introducción
  • Las PROTEINAS son moléculas formadas por cadenas lineales de aminoácidos que representan la unidad funcional de las células.
  • El término PROTEOMA se define como el conjunto completo de proteínas que podrían estar presentes en una muestra u organismo o como el conjunto de proteínas que pueden ser detectadas por una determinada metodología experimental. El término PROTEÓMICA se refiere al estudio del PROTEOMA, esto es, al conjunto de proteínas presentes en una determinada muestra biológica bajo unas determinadas condiciones.
  • El estudio y comparación sistemáticos del PROTEOMA en diferentes situaciones metabólicas y/o patológicas permite identificar aquellas proteínas cuya presencia, ausencia o alteración se correlacionan con determinados estados fisiológicos. El análisis proteómico asociado a patologías concretas, permite identificar proteínas que permitirían diagnosticar la enfermedad o pronosticar la evolución de la misma. Dichas proteínas son BIOMARCADORES de la enfermedad.
  • Dentro de las líneas de investigación del GIPC se encuentra la búsqueda de Biomarcadores Proteicos para el diagnostico, pronóstico y de respuesta terapéutica, que se apoya principalmente en el Nodo de la Red Nacional de Proteómica, Proteo-Red/ISCIII.
  • Los ensayos clínicos realizados hasta el momento ponen de manifiesto la alta variabilidad intra e interindividual de los niveles de estos biomarcadores.
  • Por todo ello, existe aún necesidad de biomarcadores útiles en la práctica clínica. Teniendo en cuenta la complejidad del proceso artrósico, que implica diferentes tejidos y complicados procesos biológicos, muchos investigadores sugieren que la estrategia más prometedora debería implicar no sólo la evaluación de varios biomarcadores moleculares de forma simultánea, sino también la combinación de esta información con la obtenida mediante técnicas de imagen (RM, ecografía, RX) y la observada en clínica.
Objetivos: Nuevas Huellas Proteicas

Para verificar la aplicabilidad de las aplicaciones desarrolladas, se tratará de identificar nuevas “huellas proteicas de la artrosis”, que nos permitan diagnosticar la enfermedad y caracterizar nuevos perfiles de pacientes con artrosis con el objetivo de realizar un “tratamiento personalizado”.

Prácticas/Tareas Realizadas Para Alcanzar Los Objetivos Propuestos

En el esquema-dibujo se han ido incorporando los diferentes elementos que componen TODO el proyecto, las relaciones entre ellos y los entregables en cada fase y componente.

arquitectura-Proyecto-DIPROA

Situación actual
  • Aplicación de biobanco en producción, para gestión de muestras.
  • Se está finalizando la construcción de la aplicación de investigación, donde se centralizarán todos los datos de investigación realizados con muestras de reumatología en los grupos de investigación.
  • Infraestructura de aplicaciones definida: BioBanco, APINVEST para investigación y Software para Big Data + Hadoop (Componentes instalados con Ambari).
  • Infraestructura tecnológica montada a la espera de iniciar las pruebas de integración (previsto iniciar a principios del mes de agosto).
  • Completar los HITOS pendientes.
Conclusiones

En el proyecto actual, sobre los datos obtenidos en BigData sobre Hadoop (sistema distribuido que permitirá el procesamiento de volumenes de datos), se ejecutarán algoritmos que permitirán detectar si las muestras analizadas en el espectrómetro de masas presentan la huella proteica, así como obtener nuevas huellas.

Todas estas muestras, junto con información obtenida en otros procesos de investigación y junto con información clínica, en el DW nos permitirá la obtención de patrones, mediante técnicas de clusterización.

Toda la información obtenida en las tareas de investigación y análisis de resultados servirán para retroalimentar el sistema y mejorarlo.

Más información detallada sobre este proyecto: DIagnóstico PROteómico de la Artrosis (DIPROA).

Soluciones a medida

Un equipo de expertos de re-nombre mundial, desarrollan con mayor eficacia y con menos trabajo para asegurar el éxito del proyecto a tiempo y a un costo general más bajo total a desarrollar.